《女神宿舍的宿管君。》

房子被烧掉、爸爸失踪、也没有储蓄。

初中男生南云孝士在城市中一个人走着倒下了。

偶然相遇的女大学生和知米涅儿向他提案，让孝士去她住的大学生宿舍来担任管理员。

在女生宿舍相遇的有，对男性没有耐性的超纯情少女早乙女亚典娜、一害羞就会拳脚相向的武斗派少女战笑基丽耶、喜欢让人COSPLAY的失控型COSER弗蕾、怠惰的运动裤电波少女八月朔日赛勒涅、以及做着诡异实验的疯狂科学家和知米涅儿，全都是特异独行的美少女们。

他将担任管理员和她们一同度过每天，在逐渐认识的过程中加深羁绊。

孝士被大姐姐们耍得团团转的日常开始了。